Этот код выводит иерархический список терминов определённого словаря таксономии.
Каждый термин является ссылкой на страницу с анонсами статей, принадлежащих этому термину.
Рядом с каждым термином выводится количество документов.
Если документов нет, то нуль не выводится и название термина не является ссылкой.

Утащила код отсюда. И немного добавила, чтобы выводились только те термины, у которых есть опубликованные материалы.
Код:

$vid = 1;  // Номер словаря
$pole = array();
$items = array();
$terms = taxonomy_get_tree($vid);
//var_dump($terms);

foreach ( $terms as $term ) {
  $count = db_result(db_query("SELECT COUNT(nid) FROM {term_node} WHERE tid = %d", $term->tid));
  if (taxonomy_term_count_nodes($term->tid) > 0) //если есть ноды. Добавила!!!
    $pole[]=Array ((($count) ? l($term->name, "taxonomy/term/$term->tid")." (".$count.")" : $term->name), $term->depth, $count, $term->tid);
}
$depth =-1;
foreach ($pole as $list) {
  //$depth- глубина предыдущего уровня
  //$list[1] - глубина текущего элемента
  if ($list[1] == $depth) {
    echo "";
    next;
  }
  while ($list[1] != $depth) {
    if ($list[1] > $depth) {
      $depth++;
      echo "\n
";
      next;
    }
    if ($list[1] < $depth) {
      $depth--;
      echo "\n\n
";
    }
  }

  echo "\n
$list[0]";
  $depth=$list[1];
}

//Закрываем все открытые теги до нулевого уровня:
$depth=0;
while ($list[1] != $depth) {
  if ($list[1] > $depth) {
    $depth++;
    echo "
\n";
  }
}